jít k obsahu
Marek Turnovec
Osobní wiki
Uživatelské nástroje
Přihlásit se
Nástroje pro tento web
Hledat
Nástroje
Upravit stránku
Starší verze
Zpětné odkazy
Poslední úpravy
Správa médií
Mapa stránek
Přihlásit se
>
Poslední úpravy
Správa médií
Mapa stránek
Historie:
•
Bioinformatika
bioinformatika
Obsah
Bioinformatika
Aligners
Variant calling
Různé
Bioinformatika
http://galaxyproject.org/
http://www.hdfgroup.org/projects/biohdf/
http://evs.gs.washington.edu/EVS/
http://www.lovd.nl/3.0/home
http://ivory.idyll.org/blog/2015-pycon-talk.html
- jedna zajímavá přednáška z PyConu 2015 - video zd:
https://www.youtube.com/watch?v=jV4YMQHZmMk
https://github.com/samtools/hts-specs
- formáty (SAM, BAM, VCF…)
http://a-little-book-of-r-for-bioinformatics.readthedocs.org/en/latest/src/chapter1.html
Upravit
Aligners
BWA
Bowtie
MOSAIK
Upravit
Variant calling
GATK
FreeBayes
http://clavius.bc.edu/~erik/CSHL-advanced-sequencing/freebayes-tutorial.html
https://wiki.gacrc.uga.edu/wiki/Freebayes
https://www.biostars.org/p/95374/
Upravit
Různé
Klinické využití NGS - doporučení Eurogentestu:
http://www.eurogentest.org/index.php?id=958
Využití REGEX a ElasticSearch pro hledání v sekvencích DNA:
http://benchling.engineering/dna-regex-search/
Upravit
bioinformatika.txt
· Poslední úprava: 2016/04/22 08:33 autor:
mat
Nástroje pro stránku
Upravit stránku
Starší verze
Zpětné odkazy
Nahoru