Je-li potřeba zjistit, jestli jsou soubory stejné, stačí obvykle udělat hash pomocí:

• md5sum
• shasum (sha1sum, sha256sum…)

U textových souborů dobře poslouží diff, ještě lépe pak colordiff. V GUI je pak docela pěkným nástrojem program meld.

Pro porovnání binárních souborů (včetně prohlížení rozdílů) slouží cmp a dhex.